Итак. Из сериала мы знаем, что Остров находится вне временной линии. Отсюда можно предположить, что одновременно на Острове присутствуют все временные параллели. И попасть на Остров можно в любую временную эпоху, из одной и той же временной точки.
Скорее всего, определение временной точки прибытия, зависит от координат, по которым прибываешь на остров. В случае с вертолетом, в 4 сезоне, такие координаты были.

Отсюда можно предположить, что остров это временная константа. Тобишь находясь на острове в одно время, мы можем частично взаимодействовать с остальными временными параллелями, или слышать их отзвуки (Шепот).
В свою очередь, остров никак не меняется, за исключением небольших корректировок, вроде «дармовиля». Мы видели, что пляж, на котором жили герои, выглядит идентично, что за пятьдесят лет до событий сериала, что в наше время.

Отсюда следует, что «передвигая остров» герои не смещали его в прямом смысле слова. А сдвигали относительно временной линии, и сопутствующим ей, сдвигам земной коры.

Дальше больше. Вполне возможно, что ключевым фактором становления острова временной константой, был либо «инцидент» во времена Дармы, либо высвобождение подземной энергии в момент взрыва бункера.
А всё дальнейшее – черная скала, другие, храмы, и сам остров, это последствия этого инцидента. Так как остров стал «собирать» на себя представителей разных временных линий, тем самым строя события прошлого и будущего.
Вполне возможно, что сама внутренняя энергия острова появилась случайно, в результате высвобождения её же в другой временной параллели.

В свою очередь, некий Джейкоб, может быть не бессмертным персонажем, а человеком который просто находится вне временных линий. И благодаря загадочному маяку, он находит людей, которые должны сыграть свою роль в истории острова, попутно отмечая необходимые для их становления координаты. Тобишь места соприкосновения, в которых Джейкоб может изменить судьбу человека таким образом, чтобы она соответствовала «островной» временной линии.

В свою очередь, альтернативная реальности показанная в шестом сезоне, это не альтернатива. А последствия окончания сериала (возможно).
Если внимательно отследить все изменения в жизнях героев и судьбах персонажей, то можно предположить, что Острова в данной «альтернативе» не существовало вовсе. И персонажи прожили жизни, без вмешательства Джейкоба.

Вероятно, что в конце сериала либо Лже-Лок, либо Джейкоб, а может и какая-то третья сила, будет вынуждена затопить остров. Что приведёт к его изъятию из всех временных параллелей и изменению временной линии как таковой.
А показанным нам, в начале 6 сезона остров, с домами Дармы, это не более чем эхо Острова, аналогичное шепоту, так как дома дармы и сломанная статуя соответствуют данному времени.

все вполне логично из твоей истории, только с трудом понятно откуда появился маяк. Если все произошедшее на острове случайное стечение обстоятельств. Постройки, бункеры были сделаны людьми для исследований происходящего на остове. Маяк люди (дхармовцы) построить сами не могли - происходящее на нем выходит за пределы естественного. В прочем как и многие другие события на нем, хотя бы Лок превращающейся в дым (или наоборот)...

Маяк это вещь, из разряда "черного дыма" и Джейкоба. Ведь кто-то сделал этого Джейкоба защитником острова. Пока-что в сериале дано слишком мало информации, чтобы попытаться строить логические цепочки. Про дым что-то начали рассказывать только в последней серии пятого сезона.
Скорее всего маяк относится ко временам постройки Храма и Статуи.

интересно зачем на самом деле приплыл Уидмор. защищать остров или ...