Не все так просто. Как это обновляться из папки в ту же папку?
Я не совсем понял, зачем их предварительно сохранять на винте, но с недавних пор в KIS есть фишка "Копирование обновлений". Настрой ее так же, как само обновление, только в другую папку. А потом из этой папки можно обновить и сам KIS.
Второй вариант - просто скопировать всю папку с FTP и тоже обновиться с нее.