Я 2 раза сносил систему после установки Kubuntu-desktop и Xubuntu-desktop соответственно, и вот нашел хорошую пачку команд для вычищения системы от данных метапакетов.
Так же на сайте, с которого я все это спер написано, что можно устанавливать и сносить (K,X)ubuntu-desktop с помошью aptitude одной командой

Кстати в чем разница aptitude и apt-get?
П.С. Последнюю команду замените по своему усмотрению.