Думаю, все куда прозаичнее, игры раскиданы на 3 физичеких жестких диска, по этому и лежат в папках в 3 папках, а если попытаться собрать это в кучу, то думаю будут такие пляски с монтированием
Тем более, если знаешь, какая тебе нужна игра, то папку с жанром будет просто еще одним лишним даблкликом на пути к игре, а если не знаешь, то думаю тебя не спасет нахождение малоизвестной игры в папке с любимым жанром, все равно пойдешь на форум искать инфу о ней, а с этого надо было начинать.