[YuriY]

smarty, есть подозрение, что в твоём случае они оба primary - один активный , другой скрытый (как системы ставил, делил ли диски?). Для загрузки другой системы надо сделать наоборот, т. е. поставь OS менеджер и переключай системы с его помощью.
Протер глаза, а речь-то про одну систему! Ну тогда посмотри с помощью какого-нибудь раздело-делателя что произошло с разделами на твоих дисках, какой у них статус. Не исключено, что слетела винда.