Надо просто установить загрузчик Ubuntu в корневой раздел, а не в MBR, и тогда GAG его обязательно найдет (у меня у самого одна из Осей - Ubuntu, все прекрасно работает). На крайняк, чтобы совсем не рисковать, можно в Ubuntu создать аварийную загрузочную дискету, чтобы загрузить Ubuntu с нее напрямую. Уже потом, находясь в Ubuntu, можно будет совершать маневры какие душе угодно.