Второй квалификационный раунд
“Злате Моравце” (Словакия) – “Зенит” 0:2
Голы: Хаген, 38, Ионов, 90+2
“Зенит” – “Злате Моравце” 3:0
Голы: Погребняк, 10, Максимов, 61, Ким Дон Чжин, 71
Первый раунд
“Зенит” – “Стандард” (Бельгия) 3:0
Голы: Аршавин, 36, 65, Ким Дон Чжин, 84
“Стандард” – “Зенит” 1:1
Голы: Ониеву, 35 - Погребняк, 79
Групповой раунд
“Зенит” - АЗ (Нидерланды) 1:1
Голы: Тимощук, 43 (с пенальти) - Ари, 20
“Лариса” (Греция) – “Зенит” 2:3
Голы: Александру, 58, Фотакис, 62 - Погребняк, 39, Зырянов, 70, Фатих Текке, 78
“Зенит” – “Нюрнберг” (Германия) 2:2
Голы: Погребняк, 76, Ионов, 79 - Харистеас, 25, Бенко, 84
“Эвертон” (Англия) – “Зенит” 1:0
Гол: Кахилл, 85
1/16 финала
“Зенит” – “Вильерреал” (Испания) 1:0
Гол: Погребняк, 63
“Вильярреал” – “Зенит” 2:1
Голы: Франко, 75, Томассон, 90 - Погребняк, 31
1/8 финала
“Марсель” (Франция) – “Зенит” 3:1
Голы: Сиссе, 37, 55, Ньянг, 48 - Аршавин, 82
“Зенит” – “Марсель” 2:0
Голы: Погребняк, 39, 78
1/4 финала
“Байер” (Германия) – “Зенит” 1:4
Голы: Кисслинг, 33 - Аршавин, 20, Погребняк, 52, Анюков, 61, Денисов, 64
“Зенит” – “Байер” 0:1
Гол: Булыкин, 18
1/2 финала
“Бавария” (Германия) – “Зенит” 1:1
Голы: Рибери, 18 - Лусио, 60 (в свои ворота)
“Зенит” – “Бавария” 4:0
Голы: Погребняк, 4, 73, Зырянов, 39, Файзулин, 54