Да винту пофигу, старый он или новый, он или работает или умирает. Бадсектора обходятся Chkdsk и не влияют на скорость. А вот гипер фрагментация влияет, но скорее всего это действие утилиты восстановления системы - когда с винта на винт переносишь она сперва все изменения в свою папочку фиксирует на случай отката поэтому и долго. Попробуй выключи её и возможно будет щастье.