dar, на скорость особо не влияет, NCQ дает ощутимый прирост в определенных видах задач, где присутствует множество запросов к разным областям диска - например дефрагментация (что в принципе делать не нужно часто, т.к. уменьшантся срок службы HDD). Также снижается нагрузка на механику. В остальном разница незаметна.
а причем тут RAID, Вы его создавали чтоли?
http://www.oszone.net/1498/RAID