У меня на матери ASUS есть опция выбора девайса для загрузки с помощью горячей клавиши, чем я с успехом и пользуюсь для того чтобы не замешивать на одном загрузчике две чужеродные ОСи. Выглядет это в виде синего окошка с пречнем того с чего можно грузиться.
В вашем случае вы видите работу загрузчика ОСи, установленной последней, и он запрашивает не о винчестере а о выборе ОСи. Если бы первым грузился винчестер на котором не установлен загрузчик или отсутствуют системные загрузочные файлы вы увидели бы ругательство что
диск не загрузочный вставьте ситемный диск и нажмите enter.
Я подозреваю, что возможно, у вас линуховый загрузчик стоит на обоих винтах или вы до сих пор работаете со старым винчестером на котором стоят две ОС, а новый, неотформатированый, БИОС вообще игнорирует