Может это просто в ресурсах игры кто-то нарыл остатки других концовок и миссий - изначально ж был заявлен нелинейный сюжет кажись.
Да и заметно по игре что много вырезано:
По сюжету особенно в начале Джо и прочие герои часто говорят типа работай с Дереком (если не путаю чел что в порту), а он как и все прочие говорят, типа "no jobs for ya Vito". Походу раньше были неике доп миссии, которые мб влияли как раз на разные концовки.