Ну если это для тебя "сложный" выбор, то в Ведьмака играть вообще не рекомендую. Боюсь, ты себе все нервы сломаешь, ибо там выборы сложнее в десятки раз, и в каждом встреченном квесте.
Кстати, эти самые Stormcloaks и Imperial Army и есть те самые, аналоги зла и добра.